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為烈嶼最大的淡水湖，面積6平方公里，具有軍事防禦和水利灌溉的作用，四周湖景清幽靜謐、潔淨自然，而有"小西湖"之稱。陵水湖亦是小金門最重要的鳥類棲地，以至此停留渡冬的冬候鳥為主，每年10月至翌年4月間，湖面滿是水鴨、鷺、水雞，相當壯觀。

清遠湖位於烈嶼鄉的西南邊，保有豐富的生態，湖邊有許多潮間帶生物。近年來，已有部分被闢為養魚池，從疏浚的汙泥當中夾雜了許多青岐遺址的文化遺物。

雙鯉湖和慈湖相同，均以鳥類生態見長，也是金門最重要的野生鳥類棲地。雙鯉湖附近的北山和古寧頭，非但擁有戰地史蹟，更兼具豐富的人文景觀，這兒並闢有雙鯉濕地自然中心，展出金門人文和動植物生態。

慈湖與雙鯉湖相連，原為一片內海，昔駐軍於南山及湖下間築一道長達550公尺的慈堤，形成金門最大的鹹水湖，且與海相通，隨著潮汐漲落，慈堤外海的潮間帶及慈湖周邊經常可見水鳥群聚，湖畔的木麻黃樹林也是冬候鳥鸕鶿度冬的主要棲息地，秋冬時鳥況極為豐富，是

太湖為一人工淡水湖，於民國55年開鑿，面積約為36公頃，是金門規模最大的水利設施。湖面有二座小島，綠意蔥蘢，小道、涼亭點綴其間，為單調的湖面點出活潑生趣；由中正紀念林前有小徑直達湖心小島，靜坐島上涼亭，磅礡太湖與清潭之美盡入眼簾，感受格外悠閒。